在火红版中孵化口袋妖怪蛋，需先前往四之岛的饲育屋寄养符合条件的宝可梦产蛋，再将蛋带在身上累积步数孵化，搭配火焰身躯特性宝可梦可加速孵化，完成孵化后能获得对应初始形态的宝可梦。
产蛋的核心地点是四之岛的饲育屋，需通关一周目并获得彩虹通行证才能抵达，此处可同时寄养两只宝可梦，而5号道路的饲育屋仅能寄养一只，无法用于产蛋。产蛋需满足严格条件，必须选择一公一母且同属一个蛋群的宝可梦，或一只任意宝可梦搭配百变怪，百变怪可与除未发现组外所有蛋群的宝可梦配对，是最通用的产蛋搭档。传说中的宝可梦与部分特殊宝可梦属于未发现组，无法参与产蛋，亲密度越高、ID差异越小的宝可梦组合，产蛋概率越高。寄养后每行走256步会触发一次产蛋判定，频繁往返饲育屋与老爷爷对话，当他提示有好消息时，即可领取精灵蛋。
领取蛋后需将其放入队伍携带，通过行走累积步数推进孵化进度，不同宝可梦的蛋所需孵化步数不同，常见宝可梦多为5120步左右，鲤鱼王蛋所需步数最少。加速孵化的关键是携带火焰身躯或熔岩盔甲特性的宝可梦，能让孵化所需步数直接减半，鸭嘴火兽、六尾等宝可梦均具备该特性。孵化时优先选择笔直且长距离的路线，骑上自行车来回移动能快速累积步数，大幅缩短孵化时间。孵化过程中蛋会逐渐出现晃动、发出声响的变化，当变化愈发频繁时，代表即将孵化，步数达标后蛋会自动破碎，诞生5级的对应宝可梦。
孵化出的宝可梦存在丰富的遗传机制，能继承亲代的优质属性与技能，母方宝可梦或携带不变石的百变怪，可让子代有50%概率遗传相同性格。子代还会随机遗传父母2至3项个体值，提升培育优质宝可梦的效率。技能遗传方面，父方掌握的蛋技能可遗传给子代，皮卡丘或雷丘携带电气珠生蛋，能孵化出掌握高压电击的皮丘，部分宝可梦需携带特定熏香才能生出初始形态，如玛丽露携带海潮熏香可生出露力丽。
